A partir del mes de julio, sin ninguna estructura deportiva en el club tras la dimisión de Rufete y su equipo, Nuno pasó a tener plenos poderes en el área deportiva en línea directa con Lim y Layhoon Chan. Salvo y Rufete. Además el equipo perdió al central Otamendi pocos días antes de la eliminatoria de Champions negándose a entrenar y a jugar con el equipo, forzando así que el club negociara con el Manchester City.